馬永成最出名的就是涉及陳水扁國務機要費案、扁家洗錢案、南港展覽館案、龍潭購地案等案，最後一審就被依照《貪污治罪條例》判處馬永成20年有期徒刑，罪名包括中的『利用職務詐取財物』、『侵佔公有財物』等，後來靠著國務機要費除罪化才逃過一劫