留言區的配票單，上面有五名進入第一階段投票的人選縮寫：
中研院副院長周美吟、
臺大文學院前院長陳弱水、
臺大電資學院院長陳銘憲、
臺大行政副校長張慶瑞、
臺大財金系教授管中閔。

2018/1/5投票選出管中閔後，遴選委員會尚未解散，即在1/9爆出遴選委員會蔡明興委員（台哥大副董事長），未揭露、亦未利益迴避，投票給管中閔（時任台哥大獨董），管中閔在1/12辭去獨董職位。

台哥大在2017年6月通過管中閔擔任獨董案，但台大9月才核准。另外，管中閔在台哥大的審計委員會和薪酬委員會都有職位，但管在8月就已經在台哥大行使職權召開會議。
當各方爭論現實面無法先行揭露獨董名單，現行法規制度是否有招致教授兼職違法之時，管一直沒有對“何以在審計和薪酬委員會先行職權”一事進行說明。

蔡明興（台哥大副董）則在2018/1/31的遴選委員會會議上迴避問題，最後解除遴選委員職位。

在監察院2019年1月提出的報告中，管中閔任職台大教授期間，曾於政治大學、中央大學、勇源基金會、國泰金等機構兼職，卻未申報台大核准。透過匿名方式「常態性」為壹週刊撰寫社論，獲取年約新臺幣65萬元之兼職報酬。
這個部分有一個案外案：2019/7/2，監察院召開公務員懲戒委員會審理管中閔彈劾案，該合議庭的委員長兼審判長為石木欽。
石木欽在2017/12/20自高等法院院長退休後，接任監察院公務員懲戒委員會委員長，直到2020/9/16辭職。但約從2019年起，石木欽與富商翁茂鍾「不當接觸」的證據不斷湧出。石木欽遭改判撤職確定 監院：贏得人民對司法信賴 | 政治 | 中央社 CNA

懲戒法院（由公務員懲戒委員會改制）在2022/11/4做出撤職石木欽，並減少退休退養金60%的判決。

至於管中閔案，委員會在2019/9/2判處管中閔申誡。

再回到管中閔爭議：2018/3/16，傳出管中閔在中國大陸的數間大學違法兼職，學校網頁上將管中閔列為兼職或客座教授。（當時噗浪上也有很多討論跟截圖）
後來這些學校都改口或澄清說管中閔只是去演講或參加會議，未支酬，並將管中閔的名字從網頁上去除。

2018/1/25，立委張廖萬堅爆料，臺大校長當選人管中閔涉嫌抄襲論文。隔日，臺大對此迅速發佈聲明表示，此論文並非已經完成之正式論文，非屬臺大「違反送審教師資格規定及學術倫理案件處理要點」之規範或處理對象，故決議不予立案調查
台大2018/3/24召開的臨時校務會議，將學倫會的成員推上第一線，詳述為何不處理管案

但日後，我們可以看到管中閔親自站到蘇宏達身邊，對林智堅案做出什麼樣的指控 管中閔抄襲案爆與林智堅案超像 網：2案並列台大校史 | 社會 | Newtalk新聞管中閔論文爆抄襲 台大學倫會列7大理由不立案 - 生活 - 自由時報電子報總之3/24這天的校務會議非常精彩，人事室脫口說出近2年有37名教授兼職，在學校流程簽辦上，有95％的同意書都採追認。台大習慣偷跑？人事室證教授兼職9成5申請皆追認 - 生活 - 自由時報電子報當天關於管中閔的提案遭到全數擱置台大校務會議秀下限？管中閔有關提案全數擱置 - 生活 - 自由時報電子報

陳方隅也針對國柯兩黨消費管中閔參選台大校長爭議發文：

我只擷取一小段，其餘有興趣請到他的臉書一讀Facebook當初看到書名，我只覺得台大根本無脊椎軟骨動物，稱什麼脊樑～（撇嘴）