由台灣政府屬意的人士介入公共電視台的人事紛爭，以及以政府預算對媒體＂置入性行銷＂等作法，都曾經引起爭議。

台灣媒體上以偽裝新聞進行宣傳的廣告買主，除了台灣政府外也包括了中國政府，學者指出的例子包括一些由中國地方政府宣傳部提供的文稿，在台灣媒體上被偽裝成新聞報導。

在新聞自由評級遭降之際，甫上任的行政院新聞局長楊永明則表示其希望台灣媒體能加強報導＂幸福新聞＂。國民黨重新取得執政權三年多以來的新聞自由下降，則受到了在野的民進黨立委批評說，總統馬英九在打壓言論自由上是向中國學習。