跑步或許多有氧運動時出現腹痛，醫學上較普遍支持的觀點有兩種。

器官充血：
一是器官充血膨脹，人體在進行運動時血液循環提升，而脾臟和肝臟是血流較高的器官，因此運動時這兩器官的血流也可能較強，進而有正常的充血膨脹、壓迫到腹膜，若是在於脾臟便會出現左上腹痛，若於肝臟便右上腹痛。

呼吸調節：
另一觀點是和呼吸調節有關，人體進行運動時耗氧較高，若呼吸未妥善調節，兩側橫膈肌就有可能缺氧而出現痙攣。許多不常運動、剛開始運動的人容易有腹痛情況，就很有可能是因為此原因所致。