蘇哈托按日本的命令解散他的軍團，並回到日惹。在印尼的獨立幾乎成為事實的時候，蘇哈托與前義勇軍的同事歐麥爾·伊卜尼·斯拉梅（Umar Slamet）在1945年10月5日，一起建立了一個戰鬥單位，支援革命運動。蘇哈托領導這個部隊攻擊日軍在日惹的幾個據點，繳獲了大量軍械。後來這個單位被併入印尼武裝部隊（Tentara Keamanan Rakjat / TKR），蘇哈托也在印尼正式獨立時，晉升到了少校的位置