物理治療臨床上，低能量雷射可治療：
促進組織的癒合，例如：褥瘡、燒傷、術後傷口組織癒合不良或潰瘍等。
促進骨折的骨頭癒合。
軟組織扭傷、挫傷、拉傷或是急性運動傷害、慢性疼痛、關節炎有止痛的效用。
神經受損後的癒合。
減緩皮膚的症狀，如：濕疹、牛皮癬、單純性皰疹。
減輕外傷所造成的血腫。