一般來說，腸病毒感染成人的話通常症狀並不明顯，可能有類似感冒的症狀，兒童則有可能會發燒，或是出現疱疹性咽峽炎、手足口病等民眾比較熟知的腸病毒典型症狀。

但是，新生兒若是感染腸病毒，症狀其實會跟幼兒有些不同。除了發燒以外，林詠青醫師表示，新生兒感染的症狀也常常包括食慾下降、躁動不安等，也有可能會有皮膚出疹、腹瀉、嘔吐等情形，如果嚴重感染可能還會引發凝血功能異常、心肌炎、肝炎、腦炎、敗血症等。

像上週國內有1例感染腸病毒併發重症個案，為出生未滿1個月的新生兒，感染克沙奇B4型腸病毒後便出現發燒、活動力不佳、血小板低下等情形，並併發心肌炎、肝炎、無菌性腦膜炎等重症。