日本占領婆羅洲時，中華民國領事卓還來等一行由於來不及撤離，遭到日軍逮捕。日軍亟力誘惑他參加汪偽政府外事部門，但卓領事拒絕成為漢奸，不願意當日本帝國主義的走狗，戰爭結束前遭日軍秘密殺害。後人挖掘埋葬的地方，只找到頭髮殘骸，顯示死前遭日軍殘酷地凌虐、斬首和肢解。

日軍如此痛恨他，合理推斷不只是因為他拒絕投降，而且還直指日本帝國必亡等大義凜然之言，所以日軍投降之前下此毒手。如此文天祥式的人物，《聽海湧》竟然把他改編成被日軍饒過一命，對台灣戰俘懷恨在心，在法庭上作偽證，刻意將其入罪，以報一箭之仇徐宗懋專欄》公視已墮落成公弒 - 時論廣場