高鐵的投入營運及競爭，造成台灣西部其他運具的班次減少，其中以航空受影響最大，台北至高雄間曾有一定規模的北高航線定期航班，2013年後台灣本島西部的民航線全數停飛。而在高鐵新增雲林站後，2018年亦傳出專營雲林縣往來其他縣市的日統客運有意歇業，並於2023年1月停開國道旅運。